Denizli Lisesi, Osmanlı arşivlerinde yapılan araştırmalara göre 1871 yılında Rüştiye Mektebi olarak eğitim hayatına başlamıştır. Daha sonra Liva İdadisi, Sanat İdadisi ve Sultani Mektebi adlarıyla anılan kurum, 1932 yılında Denizli Lisesi ismini almıştır. 1926-1927 yıllarında Vali Mithat Kalabalık’ın destekleriyle Türkiye'de ilk kez karma eğitim uygulamasına geçen okullardan biri olmuştur. 4 Şubat 1931 tarihinde Mustafa Kemal Atatürk tarafından ziyaret edilen okul, İsmet İnönü, Celal Bayar ve Cevdet Sunay gibi Cumhurbaşkanlarını da ağırlamıştır. Ayrıca dünyaca ünlü fizikçi Hüseyin Yılmaz ve tıp alanında önemli çalışmalara imza atan Rıdvan Ege gibi değerli isimleri yetiştirmiştir.
Zamanla yıpranan kampüs içinde, iki yıl önce güvenlik gerekçeleriyle "Eski Bina" dışındaki yapılar için eğitime ara verilmiştir. Milli Eğitim Müdürlüğü tarafından başlatılan zemin etütleri ve statik röleve çalışmalarıyla birlikte, vakıf dört aşamalı bir yeniden yapılanma planı devreye almıştır. Bu plana göre, Eski Bina için 3R (Yenile, Yeniden Kullan, Koru) prensibi doğrultusunda restorasyon projeleri geliştirilmiştir. Yeni lise binasında, depremin etkisini azaltmayı hedefleyen "Sismik İzolasyon" teknolojisi uygulanacaktır. Japonya Ryukyus Üniversitesi’nden akademik ekipler de yapı güvenliği çalışmalarına destek sunmaktadır. 2006 yılında yıkılan pansiyon binası 216 öğrenci kapasiteli olarak yeniden inşa edilecek, Atatürk Ortaokulu ve spor salonu modernize edilecektir. Projenin toplam maliyetinin yaklaşık 4,4 milyon dolar olması öngörülmekte ve finansmanda devlet yükünün hafifletilmesi hedeflenmektedir. Bu amaçla 30 bin mezunun desteğiyle kitlesel fonlama modeli uygulanacak, sponsorluk anlaşmaları yapılacak ve sosyal etkinliklerle kaynak sağlanacaktır.
Projenin nihai hedefi, Denizli Lisesi'ni Galatasaray Lisesi, İstanbul Erkek Lisesi ve Kabataş Erkek Lisesi seviyesine taşımaktır. Bu doğrultuda International Baccalaureate (IB) programına geçiş, Almanca, Fransızca ve Japonca eğitim veren şubelerin açılması ve sınıf mevcutlarının 24 kişiye düşürülmesi planlanmaktadır.
Atatürk’ün "Yokları sayanlar hiçbir mücadeleden galip çıkamazlar" sözünden ilham aldıklarını ifade eden vakıf yetkilileri, tüm mezunları ve Denizli kamuoyunu projeye destek vermeye davet etmektedir.
