Türkiye genelinde olduğu gibi İstanbul'da da seçmenler, sabah saatlerinde oy vermek üzere sandıklara gitti. Ancak, bağımsız adayların pusulaların alt kısmına yerleştirilmesi, birçok seçmenin kafasını karıştırdı. Önceki seçimlerde bağımsız adayların siyasi partilerden sonra yer aldığı pusulalarda yapılan bu değişiklik, tepkilere neden oldu. Bu durumda, bazı seçmenlerin tercihlerini yaparken, mühürü oy vermek istedikleri siyasi parti yerine hemen altındaki bağımsız adayın ismine bastığı belirlendi.
Sandık görevlileri, seçmenlere önemli bir uyarıda bulundu. "Siyasi partilere oy vermek isteyenlerin, sadece oy vermek istedikleri partinin hemen altındaki bölüme, bağımsız adaya oy vermek isteyenlerin ise yalnızca çizginin altına mühür basmaları gerekmektedir" şeklinde açıklamada bulundular.